پایگاه مرکز اسناد انقلاب اسلامی؛ در آذر 1357، جمعی از اساتید دانشکده کشاورزی شیراز از دکتر محمد جواد باهنر دعوت کردند تا در این دانشگاه حضور یافته و برای دانشجویان سخنرانی کند. وی نیز ضمن اجابت این دعوت، به شیراز سفر کرده و در 8 آذر 57 در دانشگاه مذکور به سخنرانی پرداخت. براساس اسناد، وی در این سخنرانی درباره ضرورت تشکیل حکومت اسلامی و ادامه مبارزه با رژیم پهلوی صحبت کرد و بعد از این سخنرانی وی بلافاصله توسط ساواک شیراز دستگیر و به تهران منتقل شد. سند زیر گزارش فرمانداری نظامی شیراز از بازداشت محمدجواد باهنر در 8 آذر 57 است.

در این گزارش که تاریخ آن 9 آذر ماه است آمده:

«موضوع: محمد جواد باهنر

بدین وسیله نامبرده بالا که برابر گزارش سازمان اطلاعات و امنیت استان فارس از طرف عده‌ای از اساتید مخالف به شیراز دعوت و سخنرانی های تحریک آمیز درباره ضرورت حکومت اسلامی و ادامه مبارزه در دانشکده کشاورزی بیان نموده با هماهنگی های لازم با سازمان مذکور در ساعت 13:30 روز 8 /9/ 1357 دستگیر و اعزام وی به تهران ضروری تشخیص داده شده. لذا نامبرده به وسیله ناحیه ژاندارمری فارس به تهران اعزام می‌گردد.»