پایگاه مرکز اسناد انقلاب اسلامی؛ بعد از پیروزی انقلاب اسلامی مجاهدین خلق به هوای سهم خواهی از نظام اسلامی سر ناسازگاری گذاشتند. در این راستا جنایات و فتنه‌انگیزی‌های این گروه بر کسی پوشیده نبود. اما همزمان با ترورهای منافقین، مهندس مهدی بازرگان یکی از کسانی بود که همچنان در حمایت از منافقین موضع‌گیری می‌کرد. در این زمینه در کتاب خاطرات آیت‌الله فاضل استرآبادی که توسط مرکز اسناد انقلاب اسلامی منتشر شده آمده است:

وقتی‌ كه‌ ضد انقلاب‌ (در بهمن 1360) به‌ آمل‌ و مردم‌ آن‌ حمله‌ كرد، بنده‌ در آنجا حاضر شدم‌ و در مراسم‌های‌ مختلفی‌ كه‌ برگزار گردید، شركت‌ كردم؛ چه‌ مراسم‌ سوم‌ شهدا، چه ‌هفتم‌ و چه‌ چهلم‌. به‌ همین‌ مناسبت‌ از یكی‌ از نمایندگان كه‌ نوبت‌ نطق‌ قبل‌ از دستور او بود، حدود دو دقیقه‌ وقت‌ گرفتم‌ و در این‌ مدت‌ اندك در مورد جریان‌ آمل‌ و در مذمت‌ سازمان‌ مجاهدین‌ خلق‌ و ضدانقلاب‌ صحبت‌ كردم‌. در همین‌ نطق‌ گفتم‌ كه‌ با كمال ‌تأسف‌ و با فجایعی‌ كه‌ این‌ گروه‌ها می‌آفرینند، آقای‌ بازرگان می‌گوید: «این‌ها فرزندان ‌من‌ هستند. این‌ها ایرانی‌ هستند و شناسنامه‌‌ ایرانی‌ دارند». بعد از سخنرانی‌ آقای‌ صباغیان‌ نزد من‌ آمد و گفت:‌ «حرف‌های‌ شما درست‌ نبود. چرا چنین‌ صحبتی‌ كردی‌؟» «گفتم:‌ چرا اعتراض‌ نكنم‌، آقای‌ صباغیان‌! اولین‌ دولت‌، دولت‌ شما بود، اولین ‌وزیر كشور هم‌ شما بودید. اولین‌ استانداری‌ كه‌ برای‌ مازندران‌ در نظر گرفتید، مجاهدین‌ خلقی‌ بود. اولین‌ فرمانداری‌ هم‌ كه‌ برای‌ بابل‌ در نظر گرفتید، یعنی آقای عالمیان، او هم‌ مجاهدین‌ خلقی‌ بود، كه‌ الان‌ هم‌ فراری‌ است‌. آن‌ وقت‌ می‌گویید مااعتراض‌ نكنیم‌؟ جوابی‌ كه‌ داد این‌ بود كه‌ در زمان انتصاب آن‌ها من‌ وزیر كشور نبودم‌.