نخستین هسته جامعه روحانیت مبارز در سال ۱۳۵۶ش و با توصیههای مؤکد امام خمینی مبنی بر هماهنگی نیروهای مسلمان در مبارزه با حکومت شاه و با تشویق و حمایت مرتضی مطهری ایجاد شد. برنامهریزی راهپیماییها، سخنرانی در مساجد، تهیه شعارها، و هماهنگی و سازماندهی مبارزه بر ضد حکومت پهلوی عمدتاً برعهده جامعه روحانیت مبارز بود. جامعه به عنوان تشکلی مذهبی، سیاسی و اجتماعی پس از پیروزی انقلاب اسلامی حضوری مؤثر و تعیین کننده در مجالس قانونگذاری، مجامع و شوراهای مشورتی، قضایی، سیاستگذاری و اجرایی کشور داشته است. مرتضی مطهری، اکبر هاشمی رفسنجانی، سید عبدالکریم موسوی اردبیلی، محمدجواد باهنر، محمدرضا مهدوی کنی، سید علی حسینی خامنهای، سید محمد حسینی بهشتی، محمد یزدی ، محمد مفتح و ... از اعضای تأثیرگذار جامعه روحانیت در نهادهای انقلاب بودهاند.