پایگاه اطلاع رسانی مرکز اسناد انقلاب اسلامی؛ روحانیون مبارز در دوره پهلوی محور اصلی گسترش و تداوم نهضت بودند. در این میان اسناد بسیاری از روابط استاد مطهری و آیت‌الله خامنه‌ای به چشم می‌خورد.
در یکی از اسناد ساواک مورخ اسفند 1352 با موضوع «مرتضی مطهری» آمده است: « یاد شده از اینکه نماز جماعت سید علی خامنه‌ای را در مشهد تعطیل کرده‌اند به شدت ناراحت شده و اظهار داشته همه مراکز حساس را که اثری دارد می‌بندند. انسان متحیر می‌ماند چه کند و چه بگوید ... وی گفت سید علی خامنه‌ای از نمونه‌های ارزنده‌ایست که برای آینده موجب امیدواری است و در این مدت کوتاه در مشهد کارهای پر ثمری انجام داده که یکی از آن‌ها جمع کردن جوانان روشنفکر و بیدار بوده و به همین جهت وی مورد توجه خمینی هم واقع شده و خمینی دستور داده که هواخواهان وی خامنه‌ای را حمایت کنند.
در ادامه "نظریه یکشنبه" چنین آمده است: « سید علی خامنه‌ای قبلاً در مسجد کرامت نماز می‌خواند و پس از اتمام نماز آیاتی از قرآن را که مورد نظرش بود تفسیر می‌نمود چند روز قبل بوی تذکرات لازم داده شده که در مسجد مذکور نماز نخواند و جلسات او تعطیل شده است ضمناً مرتضی مطهری ساکن تهران و قبلاً در حسینیه ارشاد سنخرانی می‌کرده وی یکی از افراد متعصب مذهبی است.»
منبع: گنجینه اسناد مرکز اسناد انقلاب اسلامی
